进行学校知网查重的第二次时，首先登录学校知网账号，进入查重页面，选择上传论文，系统会自动进行查重分析。接着，查看查重结果报告，了解重复率情况，并根据报告中的建议进行修改。最后，再次提交修改后的论文进行第二次查重，确保通过学校知网的查重要求。

在进行学校知网查重的第二次时，需注意检查修改后的论文中是否还存在重复或抄袭内容，可以适当调整论文结构和用词，以降低重复率。另外，可以尝试修改引用格式或增加引用内容，减少系统检测到的相似度。通过反复查重和修改，最终确保论文符合学校知网的查重标准，避免不必要的问题和纠纷。