中国知网查重系统对于文献引用的处理方式主要包括：1.文献引用的识别：系统能够识别文献中的引用部分，包括引用的文献来源、作者、年份等信息。2.比对分析：系统会将文献中的引用与知网数据库进行比对分析，判断是否存在重复引用或抄袭现象。3.生成报告：系统会生成查重报告，清晰展示文献中引用的原创性和重复程度。4.提供建议：系统会根据比对结果提供相关建议，帮助作者改善文献质量。

在使用中国知网查重系统时，作者应注意文献引用的准确性和规范性，避免错误引用或格式不规范的情况。此外，作者还应保证文献引用的完整性，不应删除或篡改引用内容。通过正确使用查重系统，作者可以提高学术论文的质量，避免学术不端行为，确保学术研究的真实性和可信度。